《不一样的美男》围绕着泰国一所男校的高一13班全体师生展开，故事开始于新学期，学校主任决定创建一个有着全新教学模式的实验班，一旦新模式成功，将会在全校推广。主角们所在的高一13班，正是有着特别教学计划的“特殊班级”。不仅如此…

在高一整年的时间里，特殊班级高一13班发生了许许多多的故事。人妖女生们从宫斗撕逼到姐妹情深齐心协力为SO和PAT申请助学金；MAX转学离开，又迎来了1班转来的高材生VAN；BOSS在PEET面前承认了和MAX姐姐的情侣关系，PEET的音乐梦想也…