“虹色之花”，是连接着一众精灵和一众光之美少女世界的特殊的花朵，长期以来为了保护自己而隐藏在地球的某处，可是过去被光之美少女们打败的黑暗力量在宇宙的某处集合并且诞生了新的更为强大的黑暗力量，而如今这黑暗力量为了让地球彻底…

这次的故事背景世界观完全和第八季动画一致。故事发生在充满了音乐的城市加音町，从小就在这座城市长大的北条响、南野奏是一对青梅竹马，长大后性格完全不合的两人为了一颗正义之心惩恶扬善而再次走到了一起，变身为强大的音乐战士与恶势…

爱一行人前往横滨摩天轮参加舞蹈比赛，却在途中迷路了。正在惊慌寻找会场的时候，企图吞噬一切的新敌人「融合」突然出现。在敌人面前，所有的光之美少女陆续登场！！为了维护世界不被黑暗掩盖且从敌人手中救出希冯，14人因而团结一心产生…

望生日宴会时，本平突然出现追赶甜点王国的“朱古娜”公主，并且夺走望美的生日蛋糕逃走。朱古娜公主为了答谢光之美少女的帮忙，便招待大家前往甜点王国。光之美少女正在享受美味的甜点时，邪恶的“姆希邦”…