一个崇拜奥特曼的男孩小勉,在一次奇妙的际遇中得到了一个红色的玻璃球,原来那是一个能够实现愿望的神奇球,而它可从不同人许下的愿望中更加彰显出许愿者心灵的善恶.....

经历了迪迦奥特曼与正义的人类拯救地球后的时期，人类的文明与科技走向了广阔的宇宙。新领域时代的开启加速了人类对未知世界的开拓。可是，一些新的邪恶力量也在这时向光明的世界展开了反扑。

奥特曼在普通人眼中是高大的巨人，就如同神一般的存在，可是他们对于自己的种族，自己的星球来说也只不过是一个普通人。超进化给他们带来了完善的生命形态，同时也使他们背负起了沉重的历史责任，在这种历史责任感驱使下，光之巨人的足迹…